Ich hatte genau das gleiche Problem bei ner defekten Festplatte.
Hast du also schon mal die Festplatten überprüft ("CHKDSK C: /F /R" in der DOSBox ausführen)
Bei mir lags eben an Fehlerhaften Sektoren auf der HD, manchmal hat Windows etwas genau darauf ausgelagert, und schwupp *chrrzzzchrrzzzchrrzzz* und BlueScreen^^ kam total sporadisch manchmal stundenlang nix, manchmal mehrmals die Stunde...
Die häufigkeit des BS steigt natürlich je voller die HD ist...