Wenn du FAT32 meinst. Das geht theoretisch bis 8 TB. Windows (ab Win2k) hat aber eine künstliche Beschränkung auf 32 GB beim Anlegen (Formatieren) des FAT32 Dateisystems eingebaut (Windows kann durchaus größere Partitionen mit FAT32 als Dateisystem verwalten, nur nicht selbst formatieren).
Um größere Partitionen mit dem FAT32 Dateisystem zu formatieren, musst du unter Windows auf alternative Programme zurückgreifen (z.B. h2format von der c't; ein Konsolenprogramm, also ohne GUI).
Bedenke aber, dass FAT32 starke Beschränkungen hat, wie beispielsweise die maximale Dateigröße von 4 GB. Unter anderem deshalb kann man es daher nur noch für externe Festplatten gebrauchen, die an Stand-Alone-Geräten betrieben werden sollen, die nur das FAT-Dateisystem kennen.