Genau das selbe Problem habe ich derzeit auch.
Ich benutze Vista Ultimate und hatte vorher eine XFS-Partition auf meiner 400GB-Platte. Diese musste ich bei der Vista Installation löschen und habe dann gleich (im Vista-Setup) eine neue NTFS-Partition angelegt.
Jetzt habe ich bei jedem Boot das Problem, dass mir die Partition korrekt in der Datenträgerverwaltung angezeigt wird und ich ihr dort einen Buchstaben geben kann und dann auch normal mit ihr arbeiten kann.
Habe schon mit TestDisk den MBR und die MFT zurückgesetzt, chkdsk läuft gerade durch...
Werde, falls chkdsk nicht findet, nochmal versuchen, AHCI im BIOS auszuschalten.
Hat jemand noch ein paar Ideen?