Das Problem ist: am Ende der System Partition hat Vista einige Meta Daten, darunter eine Kopie der MFT (Master File Table) abgelegt. Tools die eine System Partition verkleinern, müssen das beachten.
GParted auch in der neusten Version 0.3.9-4 tut das z.B. nicht, so meine Erfahrung. Daher kann...