zu 1) Ja, das geht natürlich (Server aber vorher herunterfahren)
zu 2) Das ist auch garkein Problem.
Der Boot USB-Stick lässt sich ganz einfach ersetzen. Er wird nur zum Booten benutzt, die Daten auf dem USB-Stick werden während dem laufenden Betrieb nicht benötigt.
1. Win32DiskImager öffnen...