@Karpfen: Steht dein Gehäuse auf einem harten Untergrund? z.b. Fliesen?
Falls ja -> Gummifüße kaufen, absorbieren die meisten Vibrationen.
Ob Vibrationen Schuld sind, testest du durch hochheben des Servers im laufenden Betrieb. Ggf. auch ein Buch o.ä. auf das Gehäuse legen, denn oben vibriert's...